做生物界的GitHub「Bioprotocol」与Science/AAAS合作提高实验可重复性36氪新药新疗法

做生物界的GitHub「Bioprotocol」与Science/AAAS合作提高实验可重复性36氪新药新疗法
2019-08-15 14:44:26  浏览量:8382   作者:责任编辑。陈微竹0371

生命科学的研讨是一个绵长的进程,科学家的汗水凝聚在一个个的试验中,科学家的成果体现在一篇篇的论文中,每一个激动人心的科学发现都是“站在伟人的膀子上”。

但是,试验室之间的信息并不是同享、通明的。与互联互通的互联网比较,科研界是一个比较关闭的圈子。这种信息不通明,使科研工作者要花费许多时刻去重复探究他人现已探究过的试验。试验成果的重现率低是生命科学研讨范畴,特别是在临床前研讨中一直存在的问题。2015年,《天然》期刊报导,美国因医学研讨成果的可重复性低,每年形成资金糟蹋高达280亿美元。

当然,生命科学研讨内涵的复杂性是导致科研成果尤其是临床前研讨成果难重现、难转化的一个首要因素。但不少调查研讨还标明,另一个重要因素在于科学家宣告的论文中,试验计划描绘过于简略,要害试验试材来历不明确,内容精确与否缺少评定。

生物范畴的“GitHub”

依据此布景,「Bio-protocol」于2011年在美国硅谷诞生,将互联网敞开同享的思想引进生命科学研讨范畴,搭建起一个可供科研工作者免费在线同享、评定、发布、评论和更新高质量生命科学试验计划的敞开渠道,可被视为生物范畴的“GitHub”,协助试验信息流转,进步生命科学研讨功率。

生物范畴“GitHub”的树立,在进步信息流转功率的一起,也添加了确保信息质量的难度,如何能确保渠道上试验计划的质量,Bio-protocol挑选了沿袭学术期刊的规范,从形式上来看,Bio-protocol不仅是“GitHub”,一起也是一本同行评定的在线学术期刊,通过学术期刊同行评定机制,以确保渠道上所发布的试验计划质量,一起也让科学家更有动力投稿。

Bio-protocol官方网站

到现在,Bio-protocol招引了全球上万名优异生命科研工作者,包含诺贝尔医学及化学奖取得者Randy Schekman, Kurt Wüthrich,现在渠道上现已发布了3000多篇试验计划,均匀每月宣告40-50篇。

与世界学术期刊协作,鼓舞更多科研人员同享试验计划

36氪独家得悉,近来Bio-protocol与美国科学促进会AAAS树立了战略协作,两边会一起推动生命科学研讨范畴的通明化进程,进步科学研讨成果的可重复性水平。

2019年7月9日,AAAS与Bio-protocol签约典礼,相片摄于AAAS总部 拍摄: 《科学》期刊 A. Lee

左:《科学》系列期刊出书人 比尔‧莫兰(Bill Moran)右:Bio-protocol开创人兼董事长 何芳连

学术期刊中的论文,一般侧重于叙述试验成果及科学发现的重要性,较少会细节展现所选用的试验计划全貌。近年来,学术期刊出书社、杂志社也越来越意识到展现试验计划的重要性,由于需求确保论文中的试验可以被重复。Bio-protocol恰恰能给学术期刊带来一个很好的弥补,凭仗渠道一起的、专业的同行评定机制,自2016年起,Bio-protocol已与包含eLife,Journal of Cell Biology,Journal of Neuroscience,Journal of Biological Chemistry等在内的8家世界威望科学期刊、出书社树立长时间协作关系,鼓舞更多科研人员同享试验计划。

让36氪猎奇的是,Bio-protocol与AAAS的协作,比较Bio-protocol此前与其他科学期刊、出书社的协作有什么不同?

AAAS与Bio-protocol宣告协作

一方面,两边修改将一起约请《科学》系列期刊论文作者在Bio-protocol渠道上宣告试验计划,读者可通过论文中的链接直接拜访Bio-protocol渠道上相关计划内容。依据AAAS在学术界的威望性,此次协作将大大进步科研工作者关于试验计划同享重要性的知道,鼓励更多人加入到试验计划同享的队伍中。

另一方面,Bio-protocol将和《科学》系列期刊协作为读者供给“计划讨取”服务,如果在Bio-protocol上没有相关办法文章,论文中“计划讨取” 的链接直接引导读者拜访Bio-protocol“办法讨取”网页,读者的需求将传递给文章作者,约请其同享详实的试验计划。比较早年,仅由修改向作者宣布同享办法约请的形式,与AAAS协作后,Bio-protocol将成为“用户需求驱动”为主导的试验计划同享渠道,用户需求将驱动试验计划同享规划敏捷进步。未来,每篇研评论文中运用的每一种办法,不管它多么根底或前沿,都将有具体版别宣告在Bio-protocol或其他渠道上并且直接可以链接,这将让重复一个已宣告的试验计划成为一件更简单的事,这也正是Bio-protocol的愿景。

Bio-protocol从一个草根出书渠道到取得全球顶尖科学家以及世界学术出书社的认可和支撑,其背面是开创团队对科学的热心和对项目的坚持。这个项目首要是靠开创人自己的积储来支撑。Bio-protocol开创人兼董事长何芳连博士表明,“Bio-protocol从一开端就决心要树立一个全球最大、最威望的试验计划同享渠道,从根本上进步科研的重复性和高效性。之所以用自己的资金,首要是忧虑外来资金(例如VC)将无法确保Bio-protocol渠道的学术性、专业性,乃至改动初衷和任务。”

何芳连博士是宾夕法尼亚大学博士、斯坦福大学博士后,具有超越15年分子生物学科研阅历。开创团队成员包含,联合开创人兼CEO刘峥是哥伦比亚大学博士,美国临床病理医生协会注册病理医生,具有超越15年医学及医学信息学研讨阅历。联合开创人兼AI高级顾问林元庆是宾夕法尼亚大学博士,人工智能全体解决计划企业Aibee开创人兼CEO,曾任百度研讨院院长。据介绍,Bio-protocol建立前期,开创团队成员还有地平线开创人兼CEO余凯,为Bio-protocol的建立与生长投入了许多精力与支撑。从开创团队结构不难看出,Bio-protocol从诞生起就兼具生命科学研讨的谨慎情绪与互联网敞开的同享精力。

商业化战略:捉住我国生命科学发展的机会期,赢利点瞄准试剂耗材商场

为了使渠道走得更久远,Bio-protocol还需求在统筹公益性的一起获取收益。2018年,Bio-protocol取得了来自华创本钱的天使轮出资,首要用于其商业化布局。Bio-protocol瞄准的赢利点是试剂耗材商场,其商业化首要战略之一是让试验计划、试验试剂的运用信息在线化、数据化、智能化,协助科学家轻松取得所需的试验办法和试材,完成信息找人,让科学试验更简单的一起,也为试材厂商、经销商发明巨大商业价值。

生物试验试材具有客观的添加空间,据统计,未来五年全球试剂商场的年复合添加率估计将到达10%,估计从2019年的239亿美元,添加到2024年的424亿美元。依据Technavio的数据,到2021年,全球试验室耗材商场估计将超越125亿美元,年复合添加率超越5%。在试剂、耗材商场中,试验室的需求数据是很难获取的,而Bio-protocol正好具有获取试验计划、试验试剂数据的优势。

Bio-protocol联合开创人兼CEO刘峥博士表明,“Bio-protocol面向全球商场,近2-3年将聚集在国内,由于我国通过政府多年来的继续投入,现已形成了一个体量巨大并且稳步添加的根底科研商场。此外我国正在阅历医药变革,仿制药赢利的急剧下降将直接导致生物制药工业鄙人一个阶段大幅添加研制投入。因而我国的医药立异正在阅历快速添加,咱们预期会有许多中小规划的研制型生物医药公司呈现,这正是国内生命科学发展的机会期。Bio-protocol作为一个对接世界学术规范、需求与国内科研机构及企业的桥梁,期望可以助力国内科研机构和企业掌握这一可贵的机会。”

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